Находясь у истоков современной геофизики, В.А.Магницкий одним из первых стал широко применять и использовать точные физико-математические методы в науках о Земле.

Уникальные особенности творческого стиля В.А.Магницкого — широчайшие знания и использование данных смежных, а иногда и достаточно далеких научных дисциплин, таких как петрология, геохимия, тектоника, физика твердого тела, материаловедение, ясное понимание всей сложности проблем, с которыми сталкивается исследователь в области физики твердой Земли, стремление получить ограничивающие оценки в условиях недостаточности, неточности и неполноты геофизических данных, глубокий интерес естествоиспытателя к природным процессам — ключ к пониманию роли В.А.Магницкого в геофизике. Вклад В.А.Магницкого в мировую геофизику невозможно переоценить — его работы привели к открытию ряда новых научных направлений и определили на долгое время перспективы их развития. Среди важнейших научных результатов В.А.Магницкого одно из центральных мест занимает выдвинутая им и всесторонне обоснованная гипотеза о распаде вещества нижней мантии на окислы и изменение характера химической связи с преимущественно ионной на ковалентную. Эта знаменитая гипотеза, известная под названием гипотезы Магницкого-Берча, позднее получила экспериментальное подтверждение и явилась, таким образом, крупнейшим открытием. В.А.Магницкий широко ввел в исследования внутреннего строения Земли и ее эволюции уравнения состояния вещества в условиях высоких давлений и температур. Идея, связанная с фазовыми превращениями в оливинах позволила объяснить природу переходного слоя в мантии Земли. Предложенный В.А.Магницким метод расчета поля температуры в недрах Земли по реперным точкам и комплексу экспериментальных данных о свойствах вещества дал возможность впервые получить достоверные распределения температуры в Земле. Огромное влияние на развитие мировой геофизики оказали исследования В.А.Магницкого, посвященные природе слоя низких скоростей в верхней мантии Земли, а также исследованию механизмов зонной плавки и их роли в формировании континентальной земной коры. Через всю научную жизнь В.А.Магницкого проходит изучение основных закономерностей и причин современных движений земной коры. Под руководством В.А.Магницкого было проведено изучение связей современных движений земной коры с физическими полями Земли и сейсмичностью таких крупных регионов как Восточная и Центральная Европа, Китай и др. Благодаря трудам В.А.Магницкого, эта область геодинамики образовала самостоятельное направление и стала одной из наиболее разработанных с количественной стороны разделов тектонофизики.

   Другой стороной выдающейся роли В.А.Магницкого в геофизике явилась его деятельность по созданию отечественной научной школы и подготовке научных кадров. Многие годы В.А.Магницкий заведовал кафедрой физики Земли и до сих пор заведует отделением геофизики физического факультета МГУ. Среди прямых учеников В.А.Магницкого несколько десятков докторов наук и несколько членов-корреспондентов РАН. Всех же учеников В.А.Магницкого, слушавших его замечательные лекции по физике Земли на физическом факультете МГУ или изучавших геофизику по его книгам, невозможно перечислить — так велико это  число. На уникальной монографии В.А.Магницкого «Внутреннее строение и физика Земли» (1965 г) выросло все современное поколение геофизиков.

    Работы В.А.Магницкого получили широчайшее признание в научных кругах, что выразилось в избрании его президентом Международной ассоциации сейсмологии и физики недр Земли, председателем и членом ряда международных комиссий, в награждении рядом престижных премий и наград, среди которых отметим премию им. О.Ю.Шмидта и Демидовскую премию.

Основные научные статьи, учебники и монографии:

1. Об одном из возможных случаев деформации земной коры // Изв. АН СССР, серия географ. и геофиз., 1945, № 5/6,535-542;
2. О возможном характере деформаций в глубоких слоях земной коры и подкоровом слое // Бюл. МОИП, 1948, № 2, 3-22;
3. Исследование широких волн геоида путем совместного использования геодезических и гравиметрических данных // Изв. АН СССР, 1948, № 3, 213-216;
4. Геодезические данные о состоянии вещества верхних слоев Земли // Тр. Совещания по методам измерения движений и деформаций земной коры. М., Геодезиздат, 1948;
5. К вопросу о выделении локальных гравитационных аномалий // Изв. АН СССР, Сер. географ. и геофиз., 1949, № 6, 556-562;
6. Основные вопросы геологического использования гравиметрических данных // Тр. МИИГАиК, 1950, вып.8;
7. К вопросу о сжимаемости и плотности оболочки Земли // Вопр. космогонии, 1952, т.1;
8. Основы физики Земли // М., Геодезиздат, 1953, 290 с.;
9. О физическом состоянии вещества в глубоких областях земного шара // Тр. Геофиз. ин-та АН СССР, 1955 вып. 26, 61-85;
10. Внутреннее строение Земли // Природа, 1956, № 7; К вопросу о происхождении и путях развития континентов и океанов // Вопр. космогонии, 1958, т. 6, 5-38;
11. Причины вертикальных движений земной коры по геофизическим данным // Int. Geol. Congr., 20 sess. Geofisica, Mexico, 1958;
12. Свойства оболочки Земли и природа переходного слоя // Изв. АН СССР, сер. географ. и геофиз.,1959, № 1 (с В.А.Калининым);
13. Теория фигуры Земли // М., Геодезиздат, 1961, 256 с. (соавт. Бровар В.В., Шимбирев Б.П.);
14. Оболочка и кора Земли // Сов. геология, 1961, № 5, 3-16;
15. The waveguide in the Mantle of the Earthe // Apn. Geofis., 1961, v. 14, n. 1 (Co-auth. Khorosheva);
16. Об общей направленности развития земной коры // Изв. АН СССР, сер. геофиз, 1962, № 8;
17. Зонная плавка как механизм образования земной коры. // Изв. АН СССР, сер. геол. 1964, № 11, 3-8;
18. Theoric der Figur der Erde // Berlin. VEB. Verlag., 1964, 326 p., сoauth.;
19. Внутреннее строение и физика Земли // М., Недра, 1965, 379 с.;
20. The Internal Structure and Physics of the Earth // Washington, NASA, 1967, 447 p.;
21. Слой низких скоростей верхней мантии Земли //М., Наука, 1968, 25-29;
22. О температуре и составе нижней мантии Земли // Изв. АН СССР, Физика Земли, 1968, № 11, 3-9;
23. О возможных причинах современных вертикальных движениях земной коры // Бюл. МОИП, 1969, № 5 (в соавторстве);
24. Low-velocity layers in the upper mantle // The Earth's Crust and Upper Mantle, Geophys. Monograph., 1969, n 13 (co-outh.);
25. Эволюция геофизики // Изв. АН СССР, Физика Земли, 1970, № 4 ( в соавторстве );
26. Проблемы фазовых переходов в верхней мантии Земли и ее связь с развитием структуры земной коры // Связь поверхностных структур земной коры с глубинными. Киев, Наукова Думка, 1971 (в соавторстве);
27. Об эффектах смазочного слоя, возникающих при перемещении литосферы // Докл. АН СССР, 1974, № 3 (в соавторстве);
28. О горизонтальных и вертикальных перемещениях литосферы // Изв. АН СССР, Физика Земли, 1974, № 9 (в соавторстве);
29. Современные движения земной коры // Изв. АН СССР, Физика Земли, 1974, № 9 (в соавторстве);
30. О природе современных движений земной коры // Вестн. АН СССР 1976, № 3; Модели Земли // М., Знание, 1978, 64 с.;
31. Об унаследованности современных вертикальных движений земной коры. Изв. АН СССР, Физика Земли, 1978, № 10 (в соавторстве);
32. Некоторые общие вопросы динамики Земли. // Тектонофизика Земли, М., Наука, 1978… 35 с. (в соавторстве);
33. Thermal model for lithospheric thinning and associated uplift in the neotectonic phase of introplate orogenic activity and continental rifts // Journal of Geodynamics, 1985, n 3, 137-153;
34. Состояние проблемы геофизики анизотропных сред // Физика Земли, 1986, № 6 (в соавторстве);
35. Современная и новейшая геодинамика и сейсмичность Китая // Физика Земли, 1993, № 10 (в соавторстве);
36. Тензорные характеристики неотектонических изгибных деформаций и кривизны поверхности фундамента литосферы Восточно-Европейской платформы // Докл. Академии Наук, 1995, т. 340, № 3 (в соавторстве);
37. О пространственной периодичности современных вертикальных движений на территории Китая // Физика Земли, 1995, № 5 (В соавторстве);
38. О возможности плавления пород земной коры при интенсивном складкообразования (на примере Памира) // Докл. Академии Наук, 1998, т. 363, № 5 (в соавторстве).